Μια μονάδα flash U3 δεν χρειάζεται να απεγκατασταθεί με τον συμβατικό τρόπο που απεγκαθιστάτε τις μονάδες δίσκου μέσω των Windows. Αφαιρέστε με ασφάλεια τη μονάδα flash U3 όπως θα κάνατε με μια μονάδα USB. Για παράδειγμα, σε έναν υπολογιστή με Windows, αυτό μπορεί να γίνει κάνοντας κλικ στο εικονίδιο Safely Remove Hardware and Eject Media στη γραμμή εργασιών, επιλέγοντας το γράμμα της μονάδας που αντιστοιχεί στη μονάδα flash U3 και, στη συνέχεια, επιλέγοντας «Eject».