Δεν υπάρχει οριστική απάντηση σε αυτό το ερώτημα. Υπάρχουν πολλές θεωρίες αλλά δεν έχουν βρεθεί συγκεκριμένα στοιχεία. Μερικοί άνθρωποι πιστεύουν ότι ο ιός προήλθε από μια υγρή αγορά στο Wuhan της Κίνας, όπου πωλούνταν ζωντανά ζώα για φαγητό. Άλλοι πιστεύουν ότι μπορεί να ξέφυγε κατά λάθος από ένα εργαστήριο. Άλλοι πάλι πιστεύουν ότι απελευθερώθηκε σκόπιμα ως μέρος μιας επίθεσης βιολογικού πολέμου. Υπάρχει επίσης η πιθανότητα να είναι ένας ιός που εμφανίζεται στη φύση που δεν είχε προηγουμένως εντοπιστεί.