Τα μεγέθη αρχείων FLAC ποικίλλουν ανάλογα με το περιεχόμενο ήχου, αλλά συνήθως είναι μεγαλύτερα από τα αρχεία MP3. Ένα μέσο μέγεθος αρχείου FLAC μπορεί να κυμαίνεται από 20 έως 50 megabyte (MB) ανά λεπτό ήχου, ενώ ένα αρχείο MP3 του ίδιου μήκους μπορεί να είναι περίπου 3 έως 5 MB. Επιπλέον, το μέγεθος αρχείου ενός αρχείου FLAC μπορεί να επηρεαστεί από τον ρυθμό δειγματοληψίας, το βάθος bit και τον αριθμό των καναλιών.