Η προέλευση της κρυπτογραφίας μπορεί να εντοπιστεί στους αρχαίους πολιτισμούς. Οι πρώτες κρυπτογραφικές τεχνικές χρησιμοποιήθηκαν κυρίως για στρατιωτικούς σκοπούς, όπως η διασφάλιση της επικοινωνίας μεταξύ στρατιωτικών ηγετών και στρατευμάτων. Μία από τις πρώτες γνωστές χρήσεις της κρυπτογραφίας ήταν στην αρχαία Αίγυπτο, όπου τα ιερογλυφικά χρησιμοποιούνταν για την απόκρυψη μηνυμάτων. Οι αρχαίοι Έλληνες και οι Ρωμαίοι χρησιμοποιούσαν επίσης κρυπτογραφικές μεθόδους, συμπεριλαμβανομένου του κρυπτογράφησης του Καίσαρα, ο οποίος ήταν ένας κρυπτογράφησης αντικατάστασης που πήρε το όνομά του από τον Ιούλιο Καίσαρα. Κατά τον Μεσαίωνα, η κρυπτογραφία ασκήθηκε από ισλαμιστές μελετητές, οι οποίοι συνέβαλαν σημαντικά στον τομέα, συμπεριλαμβανομένης της ανάπτυξης νέων τεχνικών κρυπτογράφησης και αποκρυπτογράφησης. Η περίοδος της Αναγέννησης σημείωσε περαιτέρω προόδους στην κρυπτογραφία, με την ανάπτυξη κρυπτογράφων πολυαλφαβητικής αντικατάστασης, όπως ο κρυπτογράφησης Vigenère.