Τι είναι ένα αρχείο PDB;

Τα αρχεία PDB αποθηκεύουν δεδομένα που σχετίζονται με τις τρισδιάστατες δομές των πρωτεϊνών, των νουκλεϊκών οξέων και των συμπλόκων τους. παράγονται χρησιμοποιώντας κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ ή φασματοσκοπία NMR.

Πιο συγκεκριμένα, η Τράπεζα Δεδομένων Πρωτεϊνών (PDB) είναι μια αποθήκη για πειραματικά καθορισμένες δομές πρωτεϊνών, νουκλεϊκών οξέων και άλλων βιολογικών μακρομορίων. Τα αρχεία PDB αποθηκεύουν τις ατομικές συντεταγμένες και άλλα σχετικά δεδομένα για αυτά τα μόρια, επιτρέποντας στους επιστήμονες να οπτικοποιήσουν και να αναλύσουν τις δομές τους και να μελετήσουν τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ διαφορετικών μορίων. Τα αρχεία PDB χρησιμοποιούνται ευρέως στη δομική βιολογία, στο σχεδιασμό φαρμάκων και σε άλλους τομείς έρευνας.